大正3年(1914)8月以內地人包國榮興為首等89位蕃薯藔街內臺人士，籌組「有限責任蕃薯藔信用組合」，10月6日獲得臺灣總督府核可，正式成立，這就是今日旗山農會的起源，首任組合長包國榮興。往後幾年間，雖然組合員人數有所增加，但是資本金累積緩慢，營利有限。大正9年(1920)，受到一次世界大戰後經濟不景氣影響，組合營運陷於窘境。後在發起人之一的吳萬順(1866〜1931)提供十甲土地做為擔保下，終於獲得臺灣銀行借款而得以漸次轉圜。大正11年(1922)以後，資金運轉逐漸充裕，大正13年(1924)12月第一回全島產業組合大會時，被表揚為優良組合。大正14年(1925)，組合為了紀念此一光榮事蹟，乃積極參與旗山市街延宕多年的上水道建設，因而更名為「有限責任旗山信用利用組合」。隔年(1926)1月21日，旗山上水道正式完工通水，後因供水設備不足，且難以承擔後續改善經費，而於昭和4年(1929)9月將旗山上水道以建造之原價35,871.87圓賣給旗山街役所。
大正15年(1926)旗山信用利用組合發生財務危機，吳萬順的三子吳見草（1894〜1972）被推選為組合長，直至二次大戰末期。吳見草不僅順利解除危機，業務也日益發達，組合員超過2,000名，因此，昭和4年(1929)3月6日被高雄州知事表揚為優良組合。昭和5年(1929)12月間，為了改善事務所空間不足問題，新建帶有洋風的二樓建築為新辦公處所，即為今日古蹟本體。
旗山信用利用組合在吳見草的帶領下，除了維持既有的信貸事業外，逐年擴大經營項目，如：自耕農擔保貸款、協助零細農業經營者的長期低利貸款，兼營肥料統銷和香蕉容器製造等。並於昭和17年(1942)興建碾米工廠，這對於農村經濟發展有正面的幫助。昭和18年(1943)12月，臺灣總督府頒佈「農業會令」，隔年2月旗山信用利用組合解散，後被旗山街農業會併為旗山農業會信用部，此為旗山農會開始具有金融功能之濫觴。
戰後，農會的接收改組歷經一段混亂期，民國42年(1953)才塵埃落定而成為旗山農會。隨著旗山香蕉日益蓬勃，旗山農會業務也優異發展，辦公空間漸形擁擠，民國48年(1959)9月15日進行三樓辦公室增建工程，而成為今日建築樣貌。
整體建築物立足於二條要道交口，為順應街道走勢，臨街切45度為入口；正面立二方柱，柱身洗石子打格，其上有一簡單山牆，左右兩翼樓下開方窗，二、三樓則立柱設廊道，臺度及柱為洗石子，其餘側面貼淺色面磚裝飾，是旗山街區古老建築的地標。

資料來源：文化部文化資產局