菁寮國小於日明治44年(1911)3月28日開辦，稱菁寮公學校；同年4月15日建竹造茅屋兩間作為臨時教室，正式上課。同年10月11日新建校舍竣工，遷入新校舍上課，大正元年（1912）2月20日舉行開學典禮，日昭和16年（1941）4月1日改稱菁寮國民學校。
菁寮國小木造禮堂則建於民國40年（1951），採取一層樓大跨距空間結構，利用雨淋板作階梯狀的裝飾，左右側斜撐材立於撐牆上，正面處以山牆收邊，是一棟具有結構特色的木造建築，民國83年（1994）修建為鋼板屋頂，作為集會及室內活動場所。木造辦公室建於民國45年（1956），入口門廊細部支柱，增添許多趣味與特色，在牆體與屋頂出簷交接處，出現一道雨庇出簷，呈現視覺分割比例，突顯輕巧精緻的特色，空間配置單純而開放，注重採光及通風，現在作為家長會聯誼室、部份教職員辦公室及教學器材室，是一棟相當具有保留價值的建築物。日治時期的升旗台，位在林木蓊綠的桃花心木下，是當時公學校之遺跡，今貌只剩旗台座，其旗桿傳說在第二次世界大戰期間被拆去製造武器。2010年3月甲仙大地震後，菁寮國小木造禮堂、辦公室暨日治時期升旗台有部分損壞，室內白灰壁多處剝落，局部露出編竹牆。現正修復中。

資料來源：文化部文化資產局